▽(Rで)塩基配列解析（主に次世代ｼｰｹﾝｻｰのﾃﾞｰﾀ） ●05/25 10:06 (Rで)塩基配列解析(last modified 2021/10/22, since 2010) 遺伝子ｸﾗｽﾀﾘﾝｸﾞに基づく発現変動遺伝子検出法MBCdegの論文(Osabe et al., BMC Bioinformatics, 2021)が公開されました｡ ｺﾝｾﾌﾟﾄ自体はDGEclust (Vavoulis et al., Genome Biol., 2015)で既に提唱されているため､ MBCdeg論文の貢献は､(1) DGEclustで提案されたｺﾝｾﾌﾟﾄの有用性を独立して確認した､(2) DEGES正規化を組み合わせることでDGEclustの精度が上がる可能性､ そして(3) MBCdegの適用可能範囲(ﾃﾞｰﾀ中のDEGの割合が多く偏っているような場合にはTCCよりも精度が劣る)がDGEclustにも当てはまるのではといったあたりになります｡ MBCdegは､MBCluste
▽ｾﾙｲﾉﾍﾞｰｼｮﾝﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑ -Cell Innovation Program- ●12/22 11:37 Home About Service Glossary Links Site Map ｾﾙｲﾉﾍﾞｰｼｮﾝは､平成20年度に終了したｹﾞﾉﾑﾈｯﾄﾜｰｸﾌﾟﾛｼﾞｪｸﾄで得られた成果や基盤を活用しつつ､次世代ｼｰｹﾝｼﾝｸﾞや細胞のｲﾒｰｼﾞﾝｸﾞなどの手法を駆使して､細胞･生命ﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑを解読することを目的としたﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑです｡高速ｼｰｹﾝｻｰを整備し運用する｢ｼｰｹﾝｽ拠点｣､大量･多面的ﾃﾞｰﾀの解析のための｢ﾃﾞｰﾀ解析拠点｣を構築し､これらの基盤を活用した細胞機能解析研究やそのための革新的技術開発を行う｢先導研究｣を実施しています｡ 国立遺伝学研究所はﾃﾞｰﾀ解析拠点として､次世代ｼｰｹﾝｻｰ(NGS: Next Generation Sequencing)に対応した解析環境の開発や整備を通して､多様で大量のｹﾞﾉﾑ情報を活用した研究活動の推進に取り組んでいます｡ more Servicesｻｰﾋﾞｽ
