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皆様こんにちは! BANDAI SPIRITSがお送りする「一番くじ 仮面ライダーシリーズ」担当のC男でございます! 今週も一…
MIU404菅田将暉の久住さん「サイコパスオブザイヤー」受賞おめでとうございます
kansou
2020-09-05 17:47:19
装動にジャッカルレイダー実装!! セイバーと色紙ARTの続報も!!
バンダイ キャンディ スタッフ BLOG
2020-09-06 09:30:02
予知能力を持った一人の女性の人生を2043年まで描きあげた『クラウド・アトラス』著…
基本読書
2020-09-06 08:00:07
【マスク時代の救世主】クリオ新作クッションファンデ〓キルカバーフィクサークッショ…
あおのユートピア
2020-09-03 22:39:24
LDHに足を踏み出してひと月が経ちました
闘わなきゃLooser!
2020-09-05 23:30:53
メモ:SVG要素のその属性は本当に必要なのか
水底の血
2020-09-06 16:50:03
あるウェブページで次のようなSVG要素が直に埋め込まれていたのを見つけた。 <svg viewBox="0 0 24 24" height="32" width="32" aria-hidden="false" focusable="false" fill="non
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MIU404菅田将暉の久住さん「サイコパスオブザイヤー」受賞おめでとうございます
kansou
2020-09-05 17:47:19
わたくし、サイコパス役だいすきクラブで会長をやっている者です。ドラマ『MIU404』で菅田将暉が演じた久住さん、お…
予知能力を持った一人の女性の人生を2043年まで描きあげた『クラウド・アトラス』著…
基本読書
2020-09-06 08:00:07
社会情報学会のシンポジウムに登壇しました。
井出草平の研究ノート
2020-09-06 11:19:03
こちらで配信を見ることができます。 WS4 ゲーム規制条例と情報化社会・情報教育 ―香川県ネット・ゲーム依存症対策条…
メモ:SVG要素のその属性は本当に必要なのか
水底の血
2020-09-06 16:50:03
あるウェブページで次のようなSVG要素が直に埋め込まれていたのを見つけた。 <svg viewBox="0 0 24 24" height="32" width="32" aria-hidden="false" focusable="false" fill="none" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" stroke="currentColor" aria-lab
MIU404菅田将暉の久住さん「サイコパスオブザイヤー」受賞おめでとうございます
kansou
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わたくし、サイコパス役だいすきクラブで会長をやっている者です。ドラマ『MIU404』で菅田将暉が演じた久住さん、お…
LDHに足を踏み出してひと月が経ちました
闘わなきゃLooser!
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日本企業の新興アジア戦略と発展段階 - コロナ禍という外圧により加速する変化
自戒と備忘、虚構と酔狂
2020-09-06 15:45:44
予知能力を持った一人の女性の人生を2043年まで描きあげた『クラウド・アトラス』著…
基本読書
2020-09-06 08:00:07
メモ:SVG要素のその属性は本当に必要なのか
水底の血
2020-09-06 16:50:03
あるウェブページで次のようなSVG要素が直に埋め込まれていたのを見つけた。 <svg viewBox="0 0 24 24" height="32" width="32" aria-hidden="false" focusable="false" fill="none" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" stroke="currentColor&qu
わたくし、サイコパス役だいすきクラブで会長をやっている者です。ドラマ『MIU404』で菅田将暉が演じた久住さん、お…
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予知能力を持った一人の女性の人生を2043年まで描きあげた『クラウド・アトラス』著…
基本読書
2020-09-06 08:00:07
【#MTG】パーティ・カードは添加的散漫によって過小評価されている【#ゼンディカーの…
バーチャルVtuver豆猫さんの与太話
2020-09-04 07:37:10
【一番くじ 仮面ライダーシリーズ】一番くじ仮面ライダー新シリーズのお知らせ!
一番くじ 仮面ライダーシリーズ 開発者ブログ
2020-09-06 09:30:00
3-1で快勝!守りたい学の笑顔(フロンターレvs横浜F・マリノス)
cleanfuture_big's blog
2020-09-06 14:25:06
横浜F・マリノス(以下マリノス)との他称「神奈川ダービー」は3-1でフロンターレが逆転勝利!いやあ、日産スタジアム…
送り迎えのことばかり考えていた
まばたきをする体
2020-09-06 13:03:31
狭い部屋で寝ていると泊まりに出ていた子どもたちが帰ってきた。 子どもたちが自力で移動していることに心強い思いで…
iPhoneのCOCOAアプリ不具合がありつつも「COVID
わたくし、サイコパス役だいすきクラブで会長をやっている者です。ドラマ『MIU404』で菅田将暉が演じた久住さん、お…
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バーチャルVtuver豆猫さんの与太話
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横浜F・マリノス(以下マリノス)との他称「神奈川ダービー」は3-1でフロンターレが逆転勝利!いやあ、日産スタジアム…
送り迎えのことばかり考えていた
まばたきをする体
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iPhoneのCOCOAアプリ不具合がありつつも「COVID
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kansou
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基本読書
2020-09-06 08:00:07
郷土料理ともんの鮎コースを食べる
私的標本:捕まえて食べる
2020-09-06 14:38:11
サ・サ・サ
ものかきの繰り言2020
2020-09-06 16:01:39
『忍風戦隊ハリケンジャー』感想・第41〓42話 ◆巻之四十一「メダルと漫才」◆ (監督:渡辺勝也 脚本:酒井直行)…
夜明け前に"冒険のデザイン"を振り返る
丸くやわらかい。
2020-09-06 08:38:08
iPhoneのCOCOAアプリ不具合がありつつも「COVID-19にさらされた可能性があります」通…
思いのままにペンでスラスラ
2020-09-05 20:06:56
神様みたいだった1996年のバトルガレッガ
シロクマの屑籠
2020-09-05 15:23:05
[R] R Markdown の YAML ヘッダでハマったおまえのための記事
ill-identified diary
2020-09-05 20:24:03
R Markdown の YAML ヘッダで
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バンダイ キャンディ スタッフ BLOG
2020-09-06 09:30:02
iPhoneのCOCOAアプリ不具合がありつつも「COVID-19にさらされた可能性があります」通…
思いのままにペンでスラスラ
2020-09-05 20:06:56
郷土料理ともんの鮎コースを食べる
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3-1で快勝!守りたい学の笑顔(フロンターレvs横浜F・マリノス)
cleanfuture_big's blog
2020-09-06 14:25:06
横浜F・マリノス(以下マリノス)との他称「神奈川ダービー」は3-1でフロンターレが逆転勝利!いやあ、日産スタジアム…
LDHに足を踏み出してひと月が経ちました
闘わなきゃLooser!
2020-09-05 23:30:53
こども日記:消しゴムなのかお餅なのか。
marugao-house
2020-09-06 15:40:51
MIU404最終話のあの仕掛けへのモヤモヤ
←ズイショ→
2020-09-06 12:32:36
ネタバレ全開だから気をつけてねー。 むしろ1話から最終話まで全部観てる人を想定読者として書くので細かい説明とか…
サ・サ・サ
ものかきの
Sun Sep 6 10:10:57 2020
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PRESS RELEASEプレスリリース
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16:00-16:15
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パーマンの日記
〜バイオなパーマンの日々〜
*藤子・F・不二雄先生のパーマンとはまったく関係ありませんのであしからず
2008年11月19日
初雪
朝から雪がふったりやんだり.
夜になって一面の白.
最近冷えこみが厳しくなってきてはいたんだけど
こんなに早く初雪が降るとは.
今年の冬はなかなか厳しいかも.
Posted by qmdoor at 23:37 │Comments(0) │TrackBack(0)
2008年10月27日
虹!
4時過ぎ,完璧な虹出現!
これまでみたどの虹よりもきれいな虹だった.
これは青春ポイント高し.
Posted by qmdoor at 16:15 │Comments(0) │TrackBack(0)
2008年10月26日
弓道初段
弓道初段通りました!
最近,IAB musicやら修士の中間発表やらイベント続きでもはや緊張には慣れっこ.
凪の水面をイメージしながら引く事が出来た.
弓道を初めてから審査を受けるとこまでちょうど一年.
なかなか感慨深い.
周りのひとにお世話になってここまできたということ.感謝
Posted by qmdoor at 22:16 │Comments(1) │TrackBack(0)
2008年10月20日
皆中
8/17: ××××|××○×
9/20: ××××|×○××|×××○
10/19: ○○○○|○×○×|××××|○×××|○×××
本日の成績: 20射8中.うーむ.前半と後半で
Sudmant P, Lee H, Dominguez D, Heiman M, Burge CB (2018) Widespread Accumulation of Ribosome Associated Isolated 3’ UTRs in Neuronal Cell Populations of the Aging Brain . Cell Reports. Volume 25 Issue 9, 27 November 2018, Pages 2447-2456. e4 (Open Access)
Conway AE, Van Nostrand EL, Pratt GA, Aigner S, Wilbert ML, Sundararaman B, Freese P, Lambert NJ, Sathe S, Liang TY, Essex A, Landais S, Burge CB, Jones DL, Yeo GW. Enhanced CLIP Uncovers IMP Protein-RNA Targets in Human Pluripotent Stem Cells Important for Cell Adhesion and Survival. Cell reports, 15, 666-679, 2016.
Kapeli K, Pratt GA, Vu AQ, Hutt KR, Martinez FJ, Sundararaman B,
ZFS on Linux
お家 Kubernetes クラスターのストレージに NFS on ZFS on Linux を利用することにした。メインは r...
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The requested URL /~satsuma/d/ was not found on this server.
The resource you are looking for has been removed, had its name changed, or is temporarily
緑のgoo by ジャパンカップ 2011 (11/23)
アクセスされたURL『http://www.rosettabio.com/publications/default.htm』が見つかりませんでした。
URLに間違いがないかどうかご確認ください。
あるいは、サイトのトップページ『http://www.rosettabio.com』にアクセスしてみてください。
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2016-06-19-Sun
はてなブログに移行しました
http://teuder.hatenablog.com/-Rstudio を起動すると以下の様なメッセージがでて起動できなくなった。
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2016-05-18 (Wed) 19:20:50: http://klrm
TensorFlowを試してみた
2016年4月19日 00:23 | カテゴリ:
Diary,
Research
| タグ:
ディープ・ラーニングが流行っているので、TensorFlowを試してみました。
とりあえず、UCI Machine Learning Repositoryの定番中の定番であるIrisで分類をやってみました。
分散環境への対応とTensorFlow Playgroundが追加されたTensorFlow 0.8が話題になっていますが、0.8ではTensorBoardがうまく表示できなかったので0.7.1を使用しています。
いまさらディープ・ラーニングそのものの研究をやるつもりはありませんが、ディープ・ラーニングが使えないというわけにもいきません。
詳細はWikiにまとめてあります。
MacでTensorFlowを使う - とうごろうぃき
ツイート
TensorFlowを試してみた
Diary (439)
Research (256)
PubMed: Medline - KW [NBCI]
DNA → AA [EBI] | PROSCAN - promoter prediction [NIH] | NNPP - promoter prediction [LBNL] | Signal Scan - signal search [NIH] | SSPN - splice prediction [BDGP] | Genie - exon prediction [USCS/LBNL] | ORF Finder [NCBI] | clustalW [GenomeNET] | TFBINF - transcription factor binding sites | MOTIF - protein motif [GenomeNET] | pI/Mw [ExPASy]
Primer3web | Oligo Calculator | Web Primer - DNA and Purpose Entry | CODEHOP
NIAS DNA Bank at農林水産省農業生物資源研究所。
JCRB生物資源バンク at 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所
大阪大学・遺伝情報実験センター - Sequence Analysis Tools | データベース | 電子メールで検索できるサーバー etc. - at 大阪大学・遺伝情報実験施設
特許情報プラットフォーム - 独立行政法人工業所有権情報・研修館に
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Apache/2.0.48 (Unix) Server at ibio.jp Port 80
DDBJ をご利用のみなさまへ
国立遺伝学研究所スーパーコンピュータの定期メンテナンスに伴い、以下の日程で DDBJ および スパコンのサービスを停止しております。
サービス名停止期間
・DRA 検証処理12月10日(木) 14:00 〓 12月17日(木) 14:00
・MiGAP12月10日(木) 17:00 〓 12月17日(木) 10:00
・D-way
・DRA Search
・BioProject Search
・BioSample Search
・JGA Submission/Download Tool
・JGA Meta Viewer12月11日(金) 13:00 〓 12月17日(木) 9:00
・NIG Supercomputer
・DDBJ Read Annotation Pipeline12月11日(金) 17:00 〓 12月16日(水) 24:00
・DDBJ FTP サービス
・getentry
・ARSA
・TXSearch
・BLAST
・ClustalW
・DDBJ Homepage12月11日(金) 17:00 〓 12月17日(木) 9:00
・DDBJ塩基配列登録システム12月11日(金) 17:00 〓 12月17日(木) 10:00
皆様には大変ご迷惑をお掛けいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。
To those who use DDBJ users
DDBJ services and NIG Supe
September 28, 2015(ver. 1.2.63)
Gene OntologyTMData was updated!
Access Denied (policy_denied)
Your system policy has denied access to the requested URL.
For assistance, contact your network support team.
Access Denied (policy_denied)
Your system policy has denied access to the requested URL.
For assistance, contact your network support team.-is no longer available on this server and there is no forwarding address.Please remove all references to this resource.
Access Denied (policy_denied)
Your system policy has denied access to the requested URL.
For assistance, contact your network support team.
Terms Privacy Opt Out Choices Advertise SourceForge.JP Performance
The sequence analysis team is a thing of the past. 舊的不去,新的不來.
So I removed the page.
You should be automatically redirected to the paulh/ subdirectory in 54321...
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※教員プロフィールのページは2012年4月1日から URLを変更しています。教員一覧はこちら。
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国立情報学研究所 〒101-8430 東京都千代田区一ツ橋2-1-2
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PHYlogenetic REconstruction by use of gene eXpression and alternate mRNA splicing patterns
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PHYREX version 1.1
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Latest news
Wednesday, 23 February 2005
PHYREX v.1.1 released !!
Updated versions of the documentation documents are also released.
PHYREX
Friday, 03 December 2004
Phyrex is a program for reconstructing ancestral gene expression profiles and sequence data on a given phylogenetic tree. The program uses a Minimum Evolution algorithm to
The maximum number of runs in a string is less than its length! preprint
No.40 - 02-Jul-14
* * H-InvDB mail magazine No.40 [2014/07/02]**** http://www.h-invitational.jp/* * H-InvDB, Annotated Human Gene Database This is H-InvDB mail magazine No.40This mail magazine is to announce information useful to H-InvDB users: release announcements, introduction of the tools, introduction of annotation data, etc.---------------------------------------------------------------*** Contents * H-InvDB news: 10th Anniversary of H-InvDB Change of H-InvDB management office Termination of some accompanying services of H-InvDB ---------------------------------------------------------------*** H-InvDB news:** 10th Anniversary
フルーツビール
ペールエール
タブレットアクセサリー
あまちゃん
ニューバランス男子
インド人完全無視カレー
夏フェス
レディーズファッション
レディーズバッグ
レディーズ小物
Last Updated $Date: 2014-02-12 18:20:20 +0900 (Wed, 12 Feb 2014) $
”Next-generation Bioinformatics: connecting bases to genes, networks and disease”,
Paul Horton
Editorial for a special issue of Briefings in Bioinformatics I was guest editor for collecting articles loosely based on invited talks and other topics presented at the ISCB-Asia/SCCG 2012 conference.
Briefings in Bioinformatics, doi:10.1093/bib/bbt090, 2014.
[Manuscript]
>アクセスしようとしたページは表示できませんでした。
403 Forbidden
このエラーは、
表示するページへのアクセス許可がなかったことを意味します。
以下のような原因が考えられます。
アクセスが許可されていない(パーミッション等によって禁止されている)。
デフォルトドキュメント(index.html, index.htm 等)が存在しない。
Reprint of paper about Zerg in Bioinformatics 19: 1035-1036, 2003
Download
libzerg_1.0.6.tar.gz -the main Zerg library.
Related software
pyzerg - a Python wrapper for Zerg, by Leighton Pritchard.
Installation instructions for libzerg and libzerg-perl.
Please send bug reports to
Dirk Eddelbuettel
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Talks
Other
Rcpp (local page)
Rcpp website
RInside
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CRANberries
R/Finance Conferences
Quantian
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Version 0.7.9.2 (dated 2006-02-26, released 2006-03-01)
Second release based on Knoppix 4.0.2
Quantian software changes:
yet again grown in size: 2.7gb iso file containing over 2570 Debian packages, over 870 R packages, and a few direct source installation to complement;
split over two compressed loop images of 1.66 and 1.19 gb, respectively;
updates of packages in 0.7.9.1 that were held by the ongoing C++ library transition: now with KDE 3.5 (and some 3.4 apps)
added Java 1.5.0 SD
v0.3.1 (latest release)
Version 0.3.1: tar.gz (md5)
Sorry! This site is experiencing technical difficulties.
Try waiting a few minutes and reloading.
(Can’t contact the database server: Can’t connect to local MySQL server through socket ’/var/lib/mysql/mysql.sock’ (2) (localhost))
You can try searching via Google in the meantime.
Note that their indexes of our content may be out of date.
BioRuby WWW
アクセスが許可されておりません。
You don’t have permission to access the requested page.
AFFRIT Portal
農林水産研究情報総合センター/Agriculture, Forestry and Fisheries Research Information Technology Center
スマートフォン専用ページを表示
企業研究者の独学でバイオインフォティクス
企業にいると自由に研究ができない苦しみを誰もが感じると思います。 私もその一人です。
この不自由な状況を打破するため、また趣味として研究をするために、コンピューターだけで研究ができる可能性のあるバイオインフォマティクスを独学で学ぶブログです。
ゴールは、一流科学誌への論文投稿です。
2006年02月19日
Yahoo!とGoogleの比較(2)得意なサイト
また、理系のためのインターネット検索術で記載されていた、YahooとGoogleの違いについて。
Yahoo!は公式サイトの検索が得意で、Googleは人気のあるサイトの検索が得意であるそうです。 これは、Yahoo!は人手で登録しているのに対して、Googleは他のサイトからのリンクの数でランク付けしている事が原因の様です。
実際に、『バイオインフォマティクス』を検索語にして、Yahoo!とGoogleの検索結果を比較してみます。
Yahoo!の結果(2006.2.19現在)
第一位 日本バイオインフォマティクス学会
第二位 三菱スペース ソフトウェアーのバイオインフォマティクス事業部
第三位 バイオインフォマティクス推進センター
第四位 アマゾンで販売している書籍バイオインフォマティクス ゲノム配列から機能解析へ
第五位 アマゾンで販売している書籍バイオプログラミング―バイオインフォマティクス演習
Googleの結果(2006.2
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©2008 NIFTY Corporation
_ [life] ここの更新は終えます。
Project Registration
DDBJ BioProject Database
NGS Data Analysis
DDBJ Read Annotation Pipeline
GIB (GIB·GIB-V·GTPS)
コメント( 1001 )
矢田 哲士 助教授
京都大学大学院情報学研究科
知能情報学専攻
〒606-8501 京都市左京区吉田本町
電話 075-753-9110
FAX: 075-753-9110
Email: yt@i.kyoto-u.ac.jp
オフィス:工学部10号館1階101号室
平成16年6月現在
研究活動
研究テーマ
バイオインフォマティクス, ゲノム情報科学
機械学習アルゴリズムによる生物配列データからの情報抽出研究
確率文法の枠組みを導入した配列情報のモデル化研究
配列情報の表現モデルによる未知の生物配列データからの情報発見研究 (ゲノム配列からの遺伝子発見や遺伝子の発現条件の推定など)
最近の主要論文・著書
T. Ota, Y. Suzuki, T. Nishikawa, et al.
Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs.
Nat. Genet., 36:40-45, 2004.
T. Yada, Y. Totoki, Y. Takaeda, Y. Sakaki, and T. Takagi.
DIGIT: a novel gene finding program by combining gene-finders.
Proc. of Pacific Sympo. on Biocomputing ’03, pages 375-387, 2003.
K.
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_ Marnie [Clear, inofrmiavte, simple. Could I send you some e-hugs?]
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Powered by Ruby version 1.8.5
Forbidden
You don’t have permission to access /~knakai/jref.html on this server.
[130R] Xfind キーバインド
[akiraani] 第7回MMD杯雑感とか
[Led] 福島原発周囲の線量測定マップ公開
[QwertyZZZ] Pentax Q KQマウントアダプタ
[iida] TomcatのAJPコネクタに脆弱性 (CVE-2011-3190) 発覚
La Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire (SFBBM), société savante créée en 1914, reconnue d’utilité publique, organise à Strasbourg, du 14 au 17 décembre 2010, le 37ème Forum des Jeunes Chercheurs. Cette manifestation qui a pour but de promouvoir les échanges entre jeunes scientifiques, rassemblera environ 150 participants.
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中村保一のWebサイトは http://charles.genes.nig.ac.jp/members/yn/ に移行いたしました (2010.7.30)
Searching 244 packages of 191,030 contents
UNIX互換OSであるMac OS X(Darwin)では、Classic、CarbonおよびCocoaソフトウェアとUNIX系ソフトウェアをシームレスに利用できる。その能力を引き出すための一例を提示する。
現時点では、Mac OS X 10.4 (Tiger) あるいはMac OS X 10.5 (Leopard)が主流と思われるので、本サイトの手順通りには行かないと思われます。TigerあるいはLeopardでは未検証のため、自己責任で対応して下さい。
今後、本サイトの更新予定はありません。今回はデッドリンクの削除等、最小限のメンテナンスのみです。2010年4月26日改訂
PowerBook G4(1GHz|1GB SDRAM|60GBHD)-Mac OS X v10.3 (Panther)でUNIX環境を構築後、EMBOSSを導入した作業メモとして公開する。
EMBOSSのダウンロードサイト(http://emboss.sourceforge.net/download/)にアクセスし、最新バーション(2005年5月21日時点ではEMBOSS-2.10.0.tar)を$HOME(ホームディレクトリ)にダウンロードする。【注】2010年4月24日時点での最新バーションは、EMBOSS-6.2.0.tar.gz
MAC OS X - Software - Downloadサイトへアクセスし、eBioToolsをダウンロードする。
【注】”eBioTools 3
No updates since February 28, 2010 10:57 pm
Page generated March 30, 2010 11:57 pm
2010-01-24 [長年日記]
∩(・ิo・ิ*)∩
2010|01|
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